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    Pytorch 如何加速Dataloader提升数据读取速度

    作者:MKFMIKU 时间:2021-08-13 17:47

    在利用DL解决图像问题时,影响训练效率最大的有时候是GPU,有时候也可能是CPU和你的磁盘。

    很多设计不当的任务,在训练神经网络的时候,大部分时间都是在从磁盘中读取数据,而不是做 Backpropagation 。

    这种症状的体现是使用 Nividia-smi 查看 GPU 使用率时,Memory-Usage 占用率很高,但是 GPU-Util 时常为 0% ,如下图所示:

    如何解决这种问题呢?

    在 Nvidia 提出的分布式框架 Apex 里面,我们在源码里面找到了一个简单的解决方案:

    https://github.com/NVIDIA/apex/blob/f5cd5ae937f168c763985f627bbf850648ea5f3f/examples/imagenet/main_amp.py#L256 ​

    class data_prefetcher():
        def __init__(self, loader):
            self.loader = iter(loader)
            self.stream = torch.cuda.Stream()
            self.mean = torch.tensor([0.485 * 255, 0.456 * 255, 0.406 * 255]).cuda().view(1,3,1,1)
            self.std = torch.tensor([0.229 * 255, 0.224 * 255, 0.225 * 255]).cuda().view(1,3,1,1)
            # With Amp, it isn't necessary to manually convert data to half.
            # if args.fp16:
            #     self.mean = self.mean.half()
            #     self.std = self.std.half()
            self.preload()
    
        def preload(self):
            try:
                self.next_input, self.next_target = next(self.loader)
            except StopIteration:
                self.next_input = None
                self.next_target = None
                return
            with torch.cuda.stream(self.stream):
                self.next_input = self.next_input.cuda(non_blocking=True)
                self.next_target = self.next_target.cuda(non_blocking=True)
                # With Amp, it isn't necessary to manually convert data to half.
                # if args.fp16:
                #     self.next_input = self.next_input.half()
                # else:
                self.next_input = self.next_input.float()
                self.next_input = self.next_input.sub_(self.mean).div_(self.std)
    

    我们能看到 Nvidia 是在读取每次数据返回给网络的时候,预读取下一次迭代需要的数据,

    那么对我们自己的训练代码只需要做下面的改造:

    training_data_loader = DataLoader(
        dataset=train_dataset,
        num_workers=opts.threads,
        batch_size=opts.batchSize,
        pin_memory=True,
        shuffle=True,
    )
    for iteration, batch in enumerate(training_data_loader, 1):
        # 训练代码
    
    #-------------升级后---------
    
    data, label = prefetcher.next()
    iteration = 0
    while data is not None:
        iteration += 1
        # 训练代码
        data, label = prefetcher.next()
    

    这样子我们的 Dataloader 就像打了鸡血一样提高了效率很多,如下图:

    当然,最好的解决方案还是从硬件上,把读取速度慢的机械硬盘换成 NVME 固态吧~

    补充:Pytorch设置多线程进行dataloader时影响GPU运行

    使用PyTorch设置多线程(threads)进行数据读取时,其实是假的多线程,他是开了N个子进程(PID是连续的)进行模拟多线程工作。

    以载入cocodataset为例

    DataLoader

    dataloader = torch.utils.data.DataLoader(COCODataset(config["train_path"],
                                                         (config["img_w"], config["img_h"]),
                                                         is_training=True),
                                             batch_size=config["batch_size"],
                                             shuffle=True, num_workers=32, pin_memory=True)

    numworkers就是指定多少线程的参数,原为32。

    检查GPU是否运行该程序

    查看运行在gpu上的所有程序:

    fuser -v /dev/nvidia*

    如果没有返回,则该程序并没有在GPU上运行

    指定GPU运行

    将num_workers改成0即可

    以上为个人经验,希望能给大家一个参考,也希望大家多多支持站长博客。

    jsjbwy